CellPhoneDB: Din hija għodda ta 'analiżi ta' komunikazzjoni interċellulari bbażata fuq data ta 'traskriptome ta' ċellula waħda. CellPhoneDB jista 'jiżvela interazzjonijiet ċelluli-ċelluli billi janalizza interazzjonijiet ligand-riċettur. L-għodda tinkludi database kbira ta 'pari ligand-riċettur magħrufa u tista' tikkalkula s-sinifikat ta 'kull interazzjoni f'tipi ta' ċelluli differenti bbażati fuq data ta 'ċellula waħda.
NicheNet: Din hija għodda għall-analiżi tan-netwerks tas-sinjalar interċellulari. NicheNet jista 'jbassar il-grad ta' attivazzjoni tas-sinjalar minn ċellula għal ċellula u l-impatt potenzjali tas-sinjalar fuq l-espressjoni tal-ġeni taċ-ċelluli fil-mira.
scTensor: Din hija għodda ta 'analiżi tad-dejta tat-traskriptome b'ċellula waħda bbażata fuq id-dekompożizzjoni tat-tensor li tista' tintuża biex tbassar il-komunikazzjoni interċellulari. scTensor juża metodu ta 'dekompożizzjoni ta' tensor f'diversi livelli biex janalizza l-interazzjonijiet bejn pari ligand-riċettur magħrufa f'tipi ta 'ċelluli differenti.
Dawn huma biss ftit mill-ħafna għodod disponibbli għall-analiżi ta 'ċellula waħda. Meta tagħżel l-għodda t-tajba, agħmel kompromessi bbażati fuq disinn sperimentali, tip ta 'dejta, u miri ta' analiżi.